La luce solare diretta può far seccare rapidamente l'inchiostro all'interno del pennarello, rendendolo molto più difficile da riattivare. Anche il calore può far evaporare parte dell'inchiostro se si lascia la punta del pennarello esposta senza cappuccio. Il luogo migliore per conservare il pennarello è un ambiente fresco e asciutto, senza un'eccessiva esposizione alla luce solare.